一般定序服務

使用源資定序高效率,高品質,先進的 ABI 3730 系統,
定序結果平均約可達700~800bp,
最長可達 1000 bp

四大優勢:

  • 1.完善的售後服務諮詢
  • 2.迅速的發送結果報告
  • 3.專屬的數據管理系統
  • 4.專業的生物資訊分析


Primer list:


引子合成服務





使用源資Tri-Ligo Oligo合成的優勢:

  • 1.高效率的合成速度(下午五點前下訂單,隔天出貨)
  • 2.高品質的品質管理(每條primer皆經過PAGE電泳QC才出貨)
  • 3.價格合理優惠
  • 4.堅持台灣製造


NGS定序服務





1984 年人類基因體計畫 (Human GenomeProject, HGP) 以第一代定序的方法,超過10年的時間且花費30 億美方完成整個人類基因體30鹼基的定序。然而,隨著定序技術的演進與發展,2007年次世代定序 (Next generation sequencing) 的技術問世,大幅降低定序所需的成本和時間。此高效率的定序技術至今單次輸出量已可高達540-600 Gb (Illumina system),再結合上生物資訊分析的技術,次世代定序已被廣泛應用在各個不同的學術領域研究基因體、轉錄體及表觀基因體等。


Genome





藉由DNA的定序技術可得知基因體上的序列,並獲得基因、遺傳變異、親源演化、基因功能性以及藥物研究上的重要訊息,而全基因體定序 (whole genome sequencing) 是基因體研究的基礎,我們利用genome resequencing以及de novo seqeuncing兩個層面以開拓基因體資料的廣度,此外,由於轉錄體學 (transcriptomics) 、表觀基因體學 (epigenetics) 等這些研究都必須構築在完整的資料庫上,故透過基因體定序促進轉錄體學、表觀基因體學等的發展。


Whole Genome Resequencing


說明:

  • 全基因組重定序 (Whole Genome Resequencing) ,即對已知基因組序列的物種進行基因組定序,主要目的是研究在同一物種下,其個體或群體層次上進行差異性分析的方法,將所獲得的序列資料與參考文獻之序列進行比對,根據比對的結果可進一步分析其SNPs、InDels、結構變異等等,藉由NGS技術快速了解基因型 (Genotype) 與表現型 (Phenotype) 之間的關連性為何,對於人類或動植物等方面之研究將更為直接而快速。

樣品需求:

  • 樣品純度:OD 260/280值於1.7~1.9。
  • 樣品濃度:最低濃度不低 100 ng/µl
  • 樣品總量:每個樣品總量至少1 µg ( 建議 5µg ) ‧
  • 樣品溶劑:可溶解在H20或TE中。

數據分析:

  • 詳見客製化專案


De Novo Genome Sequencing


說明:

  • De novo Genome Sequencing全基因組定序及對於基因組未知的物種進行全基因組定序,並將所獲得的序列組裝成Scaffold再進一步預測其可能的基因、蛋白質編碼區、基因功能分群及分子生物途徑等等資訊,以期更加瞭解這些未知基因組的物種在親源關係上的演化或基因與表徵特性的相關性,提供更全面的研究資訊。

樣品需求:

  • 樣品純度:OD 260/280值於1.7~1.9。
  • 樣品濃度:最低濃度不低 100 ng/µl
  • 樣品總量:每個樣品總量至少1 µg ( 建議 5µg ) ‧
  • 樣品溶劑:可溶解在H20或TE中。

數據分析:

  • 詳見客製化專案


Small Genome Resequencing


說明:

樣品需求:

  • 樣品純度:OD 260/280值於1.7~1.9。
  • 樣品濃度:最低濃度不低 100 ng/µl
  • 樣品總量:每個樣品總量至少1 µg ( 建議 5µg ) ‧
  • 樣品溶劑:可溶解在H20或TE中。


Small Genome De Novo Sequencing


說明:

樣品需求:

  • 樣品純度:OD 260/280值於1.7~1.9。
  • 樣品濃度:最低濃度不低 100 ng/µl
  • 樣品總量:每個樣品總量至少1 µg ( 建議 5µg ) ‧
  • 樣品溶劑:可溶解在H20或TE中。


Exome


說明:

  • Exon外顯子是人類基因的一部分,包含著合成蛋白質所需要的信息。"外顯子組"(exome),約佔人類全基因組的百分之一。測定外顯子序列只需針對外顯子區域的DNA即可,因此遠比進行全基因組序列定序更簡便、經濟,已成為現階段基因定序工作的重心。

樣品需求:

  • 樣品純度:OD 260/280值於1.7~1.9。
  • 樣品濃度:最低濃度不低 300 ng/µl
  • 樣品總量:每個樣品總量至少10 µg‧
  • 樣品溶劑:可溶解在H20或TE中。

數據分析:

  • 詳見客製化專案


Epigenome


說明:

  • 染色質免疫沉澱法(Chromatin immunoprecipitation,ChIP)是研究體內DNA與蛋白質相互作用的重要工具,可靈敏地檢測目標蛋白與特異DNA片段的結合情況,由於真核生物基因組DNA是以染色質的形式存在,在染色質環境下,DNA與蛋白質相互作用闡明真核生物基因表現的基本途徑,因此透過ChIP技術使研究者得以瞭解染色質及其相結合的調控因子間的相互作用,通常用於轉錄因子結合位點或組蛋白特異性修飾位點的研究。而染色體免疫沉澱定序 (ChIP-Seq) 是將ChIP結合次世代定序 (Next generation sequence,NGS) 的技術,將取得的DNA片段進行高通量定序,獲得數百萬條序列並將其精確定位到基因組上,以檢測與組蛋白、轉錄因子等相互作用的DNA區段的生物訊息。

樣品需求:

  • 樣品純度:OD 260/280值於1.7~1.9;RNA、蛋白質應去除乾淨。
  • 樣品濃度:最低濃度不低5 ng/µl
  • 樣品總量:每個樣品總量至少20 ng‧
  • 樣品溶劑:可溶解在H20或TE中。

數據分析:

  • 詳見客製化專案


Metagenome


說明:

  • 多源基因體學 (Metagenomics) ,又稱為環境基因組學 (Environmental Genomics) ,是近年來發展的新學門,是研究一整個微生物群體的科學,從環境樣品萃取其中微生物的DNA加以定序後,然後進行物種鑑定、親緣、基因功能、表型關聯等分析比對,以了解環境所含微生物的多樣性。

樣品需求:

  • 樣品純度:OD 260/280值於1.7~1.9。
  • 樣品總量:每個樣品總量至少1 µg‧
  • 樣品溶劑:可溶解在H20或TE中。

數據分析:

  • 詳見客製化專案


Transcriptome





轉錄組學(transcriptomics)是在基因組學後新興的一門學科,即研究特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有mRNA的表現型態以及表現程度。對已知基因組序列的物種將進行基因比對 (mapping)。基因組未知的物種將以序列進行組裝成 contigs,再進一步預測其可能的基因、蛋白質編碼區、基因功能分群及分子生物途徑等等資訊。


RNA-Seq


說明:

樣品需求:

  • 樣品純度:OD 260/280值於1.9~2.1 之間;DNA 應該去除乾淨
  • 樣品總量:每個樣品總量至少1 µg‧
  • 樣品溶劑:可溶解在H20或TE (pH 8.0) 中。或是溶於酒精中低溫運送。

數據分析:

  • 詳見客製化專案


De Novo RNA-Seq


說明:

樣品需求:

  • 樣品純度:OD 260/280值於1.9~2.1 之間;DNA 應該去除乾淨
  • 樣品濃度:最低濃度不低 100 ng/µl
  • 樣品總量:每個樣品總量至少1 µg‧
  • 樣品溶劑:可溶解在H20或TE (pH 8.0) 中。或是溶於酒精中低溫運送。

數據分析:

  • 詳見客製化專案


Small RNA


說明:

  • Small RNA為小片段的RNA,對生物體具有非常重要的調控功能,通過各種序列特異性的RNA 基因沉默作用,包括RNA 干擾 (RNAi) 、翻譯抑制、異染色質形成等,調控mRNA轉譯成蛋白質的多寡,因而調控諸如生長發育、應激反應、沉默轉座子等各種各樣的細胞進程。藉由NGS技術,可一次獲得數百萬條的序列,改善以往傳統cloning方式以及microarray方式,更快速鑑定已知的small RNA並發現新的small RNA,及其各small RNA在生物體內表現的概況。

樣品需求:

  • 樣品純度:OD 260/280值於1.9~2.1 之間;DNA 應該去除乾淨
  • 樣品濃度:最低濃度不低 50 ng/µl
  • 樣品總量:每個樣品總量至少300 ng‧
  • 樣品溶劑:可溶解在H20或TE (pH 8.0) 中。或是溶於酒精中低溫運送。

數據分析:

  • 詳見客製化專案


客製化服務





  • 1.基因型分型服務
  • 2.檢體核酸萃取服務
  • 3.QPCR上機服務
  • 4.基因克隆服務
  • 5.標的基因定序服務
  • Genotyping Service
  • DNA/RNA Extraction Service
  • QPCR Service
  • Gene Cloning Service
  • Target Gene Sequencing


基因型分型服務 Genotyping Service


  • 分析平台: 3730 XL DNA Analyzer
  • 線上系統直接上傳訂單
  • GeneMapper 分析結果報告
  • 標準品: LIZ500, LIZ600 , ROX500
  • STR基因型別鑑定分析
  • MSI(microsatellite instability) 分析
  • DNA 片段長度分析

檢體核酸萃取服務
DNA/RNA Extraction Service


  • 自動化核酸萃取設備
  • 客製化人工萃取
  • 萃取DNA,RNA,microRNA
  • DNA/RNA 品質分析報告
  • 收件檢體:各類動植物組織,血液檢體
  • 收件檢體: 細菌,真菌    *(非致病菌)


QPCR上機服務 QPCR Service


  • 分析平台: Biorad CFX384 Real-Time PCR System
  • 基因表達定量分析 (TaqMan Probe/CYBR Green)
  • SNP 表型分析(TaqMan Probe)
  • 採用384孔盤,最小反應體積5ul


基因克隆服務 Gene Cloning Service


  • 客製化基因片段PCR放大
  • TA Cloning
  • Restrict Enzyme Cloning

標的基因定序服務
Target Gene Sequencing


  • 客製化標的基因引子設計
  • 標的基因片段PCR放大
  • 標定基因片段定序,與組裝分析


實驗室認證項目


說明:

14 01 生物科技

  • 菌液菌盤 B 041
  • 全血 B 202

14 08 生物科技

  • 基因組DNA B 041
  • 基因組DNA B 202
  • 去氧核糖核酸,核糖核酸 B 205
  • 基因組DNA B 205
  • 質體DNA, PCR擴增產物 B 205

TAF官方連結