【產品新知系列- myBaits Custom Kits (客製化探針組)】

發佈於 2024-12-6

       我們之前曾經介紹過myBaitsTargeted NGS系列產品中的Expert Predesigned Panels,是可以立即訂購使用的NGS Target enrichment kit,例如有細菌16S rRNA、古人類全基因組、菊科植物基因組等等,但是若實驗的目標物種或序列不在已有的套組中,即可參考使用另一項myBaitsTargeted NGS系列產品,由myBaits團隊提供客製化設計的myBaits Custom Kits。

        myBaitskit在建庫時針對有興趣的目標序列進行捕捉,在NGS上機時可以獲得更高的覆蓋率與深度,減少reads數浪費,節省後續分析所需的時間並提高效益。myBaits kit使用biotinylated RNA “baits”來捕捉目標基因序列,經由streptavidin-coated magnetic beads與baits結合,將非目標序列清除分離,最後所獲得的library序列可以再進行擴增,或是直接進行NGS上機。

        myBaits Custom Kits依照實驗目的可分為DNA-Seq、RNA-Seq以及Methyl-Seq三種設計方式。myBaits DNA-Seq用於基因或外顯子再次定序、新變異發現、系統發育學、轉基因檢測等;myBaits RNA-Seq用於基因表達分析或罕見轉錄組檢測;myBaits Methyl-Seq則是用於表觀遺傳甲基化定序。客製化設計流程為提供FASTA格式或基因組座標(BED format)的目標序列,myBaits設計團隊將根據這些資訊,依照實驗需求設計40bp-120bp不同長短的探針與探針覆蓋密度,例如考古學實驗可使用短片段探針,或是運用於Nanopore定序時可使用長片段探針,並在最終設計確認後,預估生產時間約34週,即可獲得專屬的NGS Target enrichment kit

 

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