一般定序
源資的一般定序使用 ABI 3730 xl 系統, 定序結果的平均長度約達700~800 bp, 最長可達 1000 bp,準確度99.99%,可同時進行96條毛細管的定序反應。
一般定序送件注意事項
Primer list
一般定序送件注意事項
| 注意事項說明 |
|---|
| 1. 除以菌體送件外,其它樣本請隨件附上DNA電泳圖片,並標示圖片中樣品之用量 (µl)。 |
| 2. 本公司提供一般常用Primer (T7、T3、SP6、M13F、M13R etc.),自行設計的Primer請標明名稱、濃度 (10 pmole/µl),每個反應至少提供5 µl。 |
| 3. 請將Plasmid DNA或PCR product 溶於ddH2O中,勿溶於TE Buffer中,以免產生干擾。 |
| 4. Plasmid DNA送件,體積需>10 µl,濃度>40 ng/µl。 |
| 5. 自行純化的PCR product ,純化後體積需>10 µl,濃度>20 ng/µl。 |
| 6. 定序完成後,剩餘之DNA保存以一個月為限,逾期銷毀。 |
備註 : 若樣品含有GC rich、GT rich等序列,需要另做特殊處理,請協助於訂單上註明。我們使用ABI原廠專屬試劑,用以解決樣品的複雜結構問題。
★想要進一步了解一般定序的相關問題,請點選本公司官網畫面 常見問答 的 一般定序常見問題 連結。
★若欲委託一般定序(DNA序列鑑定服務),請至本公司官網畫面 實驗室登入,登入後做進一步的訂購。
★若需下載一般定序服務申請書相關檔案,請點選 檔案下載 !
Primer list
| Name | Length | Oligo Sequence |
|---|---|---|
| 3'AOX | 21 | GCAAATGGCATTCTGACATCC |
| 3'DNA-BD | 24 | TAAGAGTCACTTTAAAATTTGTAT |
| 3'AD | 20 | AGATGGTGCACGATGCACAG |
| 5'AOX | 21 | GACTGGTTCCAATTGACAAGC |
| ACGFP1-R | 20 | GGTGGTGCAGATGAACTTCA |
| ACYCDuetUp1 | 19 | GGATCTCGACGCTCTCCCT |
| ADH1-TTR | 22 | GTAAATTTCTGGCAAGGTAGAC |
| AS S¡ETag 18 | 18 | GTCCATGTGCTGGCGTTC |
| BAD-F | 23 | GCTATGCCATAGCATTTTTATCC |
| BAD-R | 25 | GCGTTCTGATTTAATCTGTATCAGG |
| BGH-R | 18 | TAGAAGGCACAGTCGAGG |
| CL3 | 23 | GTTGATTGCAGTCCAGTTACGCT |
| CMV-F | 20 | ATGGGAGTTTGTTTTGGCAC |
| CMV24 | 21 | AGGCTGGTGGGCACTGGAGTG |
| CMVbeta-R | 20 | CAGACCAATGCCTCCCAGAC |
| CMV-IE | 18 | TGTACGGTGGGAGGAGGTCTA |
| ColiDOWN | 21 | TTCACTTCTGAGTTCGGCATG |
| DsRed-1211F | 20 | ACATCACCAACCACAACGAG |
| DsRed1-C | 24 | AGCTGGACATCACCTCCCACAACG |
| DsRed1-N | 21 | GTACTGGAACTGGGGGGACAG |
| DuetDown1 | 20 | GATTATGCGGCCGTGTACAA |
| DuetUp2 | 20 | TTGTACACGGCCGCATAATC |
| EGFP-3957F | 20 | TATAGTCCTGTCGGGTTTCG |
| EGFP-C | 22 | CATGGTCCTGCTGGAGTTCGTG |
| EGFP-CR | 21 | CAAACCACAACTAGAATGCAG |
| EGFP-N | 22 | CGTCGCCGTCCAGCTCGACCAG |
| GAL1 | 24 | AATATACCTCTATACTTTAACGTC |
| GAL4-ADF | 21 | TATAACGCGTTTGGAATCACT |
| GFP reverse | 22 | GCTACATACGGAAAGCTTACCC |
| GL1 | 24 | TGTATCTTATGGTACTGTAACTG |
| GL2 | 21 | CTTTATGTTTTTGGCGTCTTCC |
| HcRed1-1185F | 22 | CTTCCACTTCACCGACATCC |
| KAN-2 FP-1 | 25 | ACCTACAACAAAGCTCTCATCAACC |
| KAN-2 RP-1 | 25 | GCAATGTAACATCAGAGATTTTGAG |
| LKO-shRNA-R | 19 | CTGTTGCTATTATGTCTAC |
| M13F | 18 | TGTAAAACGACGGCCAGT |
| M13F(-40) | 17 | GTTTTCCCAGTCACGAC |
| M13R | 18 | ACAGGAAACAGCTATGAC |
| malE | 24 | GGTCGTCAGACTGTCGATGAAGCC |
| Mxe InteinR | 18 | GGCACGATGTAGGCGATG |
| N-CMV30 | 20 | AATGTCGTAATAACCCCGCCCCGTTGACGC |
| OplE2 Forward | 20 | CGCAACGATCTGGTAAACAC |
| PACT-F | 22 | CGAACCTCATAACAACTCAAAC |
| PBAD-myc-his-241F | 22 | ATCCTACCTGACGCTTTTTATC |
| pCMV | 27 | GATCCGGTACTAGAGGAACTGAAAAAC |
| pCMV-GIN-ZEO-F | 20 | CCGCTGTTTGAATGAGGCTT |
| pCMV-HA-R | 21 | CCCTGAACCTGAAACATAAAA |
| pDNR-M13R | 20 | CGAGGGAAACAGCTATGACC |
| pET Upstream | 16 | ATGCGTCCGGCGTAGA |
| pGEX3' | 23 | CCGGGAGCTGCATGTGTCAGAGG |
| pGEX5' | 23 | GGGCTGGCAAGCCACGTTTGGTG |
| PLKO.1-seg | 20 | CTATTCTTTCCCCTGCACTG |
| pMIR5' | 18 | AGGCGATTAAGTTGGGTA |
| PNRK-R | 19 | GCTCGAAAACAGCTATGAC |
| PNRK-R880 | 22 | CAAATAAAGCAATAGCATCACA |
| polyhedron F | 20 | AAATGATAACCATCTCGCAA |
| pQEF | 22 | GGCGTATCACGAGGCCCTTTCG |
| pQER | 22 | CATTACTGGATCTATCAACAGG |
| pRSET reverse | 21 | CTAGTTATTGCTCAGCGGTGG |
| pSE380F | 20 | AATCATCCGGCTCGTATAAT |
| pTrcHis forward | 21 | GAGGTATATATTAATGTATCG |
| pTrcHis reverse | 18 | GATTTAATCTGTATCAGG |
| RV3 | 20 | CTAGCAAAATAGGCTGTCCC |
| RV4 | 20 | GACGATAGTCATGCCCCGCG |
| S-DsbC-Tag | 17 | GAATTTCTCGACGAACA |
| S-tag | 17 | GAACGCCAGCACATGGACAGC |
| S-Tag-18 | 18 | GAACGCCAGCACATGGAC |
| SP6 | 18 | ATTTAGGTGACACTATAG |
| SR2 | 26 | GGTCAGGTATGATTTAAATGGTCAGT |
| T3 Promoter | 20 | ATTAACCCTCACTAAAGGGA |
| T7 Promoter Primer(T7-20) | 20 | TAATACGACTCACTATAGGG |
| T7 terminator | 19 | GCTAGTTATTGCTCAGCGG |
| T7-18 | 18 | TAATACGACTCACTATAG |
| T7-reverse | 21 | CTAGTTATTGCTCAACGGTGG |
| TA-F | 20 | CAAGGCGATTAAGTTGGGTA |
| TA-R | 20 | GGAATTGTGAGCGGATAACA |
| Trx-F | 18 | TTCCTCGACGCTAACCTG |
| Trx-R | 20 | TGTAAAACGACGGCCAGTGC |
| TrxFus forward | 18 | TTCCTCGACGCTAACCTG |
| U6 promoter | 19 | TACAAAATACGTGACGTAG |
| V5(C-term)reverse | 20 | ACCGAGGAGAGGGTTAGGGA |
| Xpress Forward | 19 | TATGGCTAGCATGACTGGT |
| α-factor | 18 | TATTGCCAGCATTGCTGC |
| XL39 | 20 | ATTAGGACAAGGCTGGTGGG |
| VP1.5 | 20 | GGACTTTCCAAAATGTCG |
| ITS4 | 20 | TCCTCCGCTTATTGATATGC |
| ITS1 | 19 | TCCGTAGGTGAACCTGCGG |
| ITS5 | 22 | GGAAGTAAAAGTCGTAACAAGG |
| 27F | 20 | AGAGTTTGATCMTGGCTCAG |
| 1492R | 22 | TACGGYTACCTTGTTACGACTT |
| 533F | 19 | GTGCCAGCAGCCGCGGTAA |
| 805R | 20 | GACTACCAGGGTATCTAATC |
★若有未列於表中之 Universal Primer ,請來電至本實驗室洽詢。
菌種鑑定服務
源資菌種鑑定檢測的優點:
1.基因鑑定方法分析細菌16S、真菌ITS,都可以鑑定到「種」的層次
2.單一菌株的菌盤,菌液均可做,也可提供微生物之基因組DNA
3.收到樣品後,5個工作天出報告
4.專屬的數據管理系統提供客戶下載檔案