【實驗技術系列- Digital PCR的應用】
相較於傳統qPCR,Digital PCR可以提供精確且數據化的資料,能做到絕對定量,對於精準醫療分子檢測、環境因子檢驗及相關學術研究等方面都是強而有力的工具,其應用範圍也相當廣泛。以下列舉幾項Digital PCR的應用:
1. 基因突變檢測及監測:
癌症突變的判定為突變的癌症細胞占整體細胞數的比例,若大於其判定的百分比數值,可視為此位點所造成的癌症病因。有鑑於Digital PCR能提供高靈敏度的數值,可以檢測到0.01%突變,醫生可以根據特定癌症基因突變位點檢測報告,精準地判定並給予相對應有效的抗癌藥物,提高治療效果,數據也能作為後續病情追蹤的指標。
2. 基因表達分析、病原體及環境檢測等:
有別於即時定量PCR透過Cq值來檢測分子之間的差異及病原體等有無等;Digital PCR能檢測低至單拷貝數的分子絕對數目,能提供準確且具高靈敏度的數據。例如:,保健食品廠可透過dPCR來測量產品中各個益生菌佔產品整體比例、市面上有已開發套組可用於檢測,如廢水檢測可以透過由 Thermo Fisher的ScientificAbsolute Q™ dPCR SARS-CoV-2 Wastewater Surveillance Kit來監測、在CAR-T細胞療法中,能夠精準測量定量病毒載體也能篩選出也有害的汙染物,以確保品質及安全等。
3. 次世代定序檢體庫的定量:
透過Digital PCR能夠檢測NGS檢體庫中的大小是否正確,同時也能對檢體庫定量,確認檢體是否適合上機,可提高上機的成功率。
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