最近源資生技推出了最新使用STR的細胞株鑑定服務，小編們也陸續介紹了許多相關的知識及說明，當進行毛細管電泳分離PCR產物，利用GeneMapper軟體分析得到STR的資料後，這些資料要如何進行比對呢？這次就來介紹一些好用的細胞資料庫及比對工具吧！

• ATCC STR Profile Database

由美國細胞資源中心 (ATCC, American Type Culture Collection)所建立的線上資料庫，只提供ATCC所販售的約400~500種人類細胞株的STR profile。可查詢每株細胞完整的STR allele數據，資料庫會定期更新，並詳細列出檢測方法與來源說明。但使用資料庫需要進行註冊並登入，以及手動比對樣本資料。

• DSMZ STR Profile Database

由德國微生物與細胞資源中心 (DSMZ, Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen)所提供的STR線上比對工具，整合包含ATCC、ECACC、JCRB、RIKEN等細胞庫的資料，收集超過3600種人類細胞株的STR資料。只要上傳或輸入STR數據 (共18個STR位點)，便可自動與資料庫進行比對，精準顯示與各細胞株的比對相似度，詳細列出比對每個位點的情況與差異。

• JCRB Cell Bank & RIKEN BRC Cell Bank

JCRB Cell Bank由日本國立細胞資源庫 (JCRB, Japanese Collection of Research Bioresources Cell Bank)所提供；RIKEN BRC Cell Bank則由日本理化學研究所 (RIKEN)提供。二者皆無比對工具，只能查詢部分細胞株的STR資料，需手動比對。主要收錄日本及東亞人種來源細胞。

• ICLAC Misidentified Cell Lines Database

國際細胞株認證委員會 (ICLAC, International Cell Line Authentication Committee)所收錄已經證實為錯誤命名或污染的細胞株名單，約有超過450種被誤用的細胞株資料，用於幫助辨識高風險細胞株。建議研究者避免使用這些細胞株，或重新鑑定來源。

• CLASTR (Cellosaurus STR similarity search tool)

瑞士生物資訊研究所 (Swiss Institute of Bioinfomatics)開發維護的Cellosaurus細胞資料庫提供的STR相似度比對工具，可以輸入高達32個STR位點，及自訂相似度的參數，與資料庫中的STR資料進行比對。Cellosaurus整合ATCC、JCRB、DSMZ、RIKEN等數十個細胞庫的資料，目前除了完整記錄有約6500種人類細胞的STR資料，並收集部分小鼠及犬的STR資料；每年進行更新4~6次，CLASTR比對資料也會同步更新。因此Cellosaurus為目前對於全球的細胞資料與研究文獻整合度最高的資料庫。

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