【實驗技術系列-無細胞蛋白質合成 (Cell-Free Protein Synthesis, CFPS) 】

發佈於 2026-5-29

What?這是什麼?

       無細胞蛋白質合成 (CFPS),顧名思義,就是在沒有活細胞的環境下,直接利用細胞蛋白質合成的核心原料,在試管中進行體外 (in vitro)蛋白質表達。這些核心原料包括:核糖體、tRNA、胺基酸,以及提供能量的 ATP 與 GTP 等。只要將帶有目標基因的 DNA 或 mRNA 模板加入含有這些原料的反應體系中,系統就會自動啟動轉錄與轉譯機制,開始生產目標蛋白質。

 

How?怎麼做到?

       CFPS 的核心關鍵在於細胞萃取物 (Cell extract/lysate)的製備。傳統上,科學家會利用大腸桿菌 (E. coli)、麥胚芽 (Wheat Germ)、兔網織紅血球 (RRL)或昆蟲細胞作為原料來源 (詳見表一)。透過物理破碎 (如超音波)或化學裂解的方式打破細胞膜或細胞壁,再經過高速離心去除細胞核、細胞壁碎片與不溶性組織,僅保留上清液中含有核糖體、RNA 聚合酶、轉譯因子及 tRNA 等關鍵組分。最後,額外補充能量再生系統 (如 ATP、GTP)與 20 種必需胺基酸,一套試管中的 CFPS 系統便大功告成。

       近年來,另一種名為 PURE 系統 (Protein Synthesis Using Recombinant Elements)的技術直接將三十多種轉錄、轉譯所需的重組蛋白、因子與核糖體依精準比例進行人工混合。PURE 系統的優點是成分完全已知且極其純淨 (Defined),但缺點在於製備成本極高,且缺乏真核細胞複雜的轉譯後修飾 (PTM)能力。

表一、常見 CFPS 系統之來源細胞與特性比較

系統類型

特點

適用場景

大腸杆菌 (E. coli)

產量最高、成本最低、技術最成熟

一般重組蛋白、結構生物學研究 (NMR/X-ray)、抗原生產、非天然氨基酸嵌入

麥胚 (Wheat Germ)

真核系統中最穩定,能合成大型、複雜的蛋白質

真核來源蛋白、蛋白質交互作用研究、結構生物學、抗原、膜蛋白

兔網織紅細胞 (RRL)

哺乳動物來源,蛋白質折疊最接近人類天然狀態

蛋白質與藥物相互作用、轉譯後修飾(PTM)研究、病毒蛋白表現

昆蟲

合成能力極強,適合分泌型蛋白

需要簡單糖基化(Glycosylation)的真核蛋白質

PURE 系統

僅由純化後的必要組分組成,成分完全已知 (Defined)

合成生物學、高純度特殊蛋白製備、體外定向進化(Directed Evolution)

 

Why?為什麼要用它?

       在使用傳統的活細胞表現蛋白時 (如大腸桿菌或哺乳動物細胞),研究人員必須隨時注意細胞的生長狀況。從質體建構、基因轉殖、細胞培養、IPTG 誘導表達、到最後的細胞破碎與純化,往往需要耗費數天甚至數週的時間。相較之下,CFPS 展現了以下幾大優勢: 

 

✔️ 極速製備:跳過了細胞生長與分盤培養的時間,製程能從數天縮短至數個小時。 

 

✔️ 可控的開放式環境:因反應在試管中進行,研究人員可以隨時加入調整各種原料濃度,甚至能加入非天然的胺基酸 (Non-natural amino acids)或螢光標記,製造出帶有特殊化學修飾的蛋白質。 

 

✔️ 可生產“毒蛋白”:有些蛋白質對活細胞具有毒性 (如膜蛋白、毒素、抗凍蛋白),細胞一旦表達就容易死亡,導致產量微乎其微。由於 CFPS 中沒有活細胞需要被保護,因此能製造出傳統方法難以取得的困難蛋白質。 

 

✔️ 純化程序更簡單:因為沒有複雜的細胞雜質,省去了繁瑣的破菌步驟,讓後續的蛋白質純化變得輕鬆許多。 

 

When?可以用在哪裡?

        

✔️ 高通量藥物與蛋白質篩選:利用微孔盤 (Microplate)在單一自動化平台上同時合成不同的蛋白質突變體,並直接進行配體結合或酵素活性測試,大幅加速新藥開發與標靶篩選的進程。 

 

✔️ 合成生物學與體外工程:利用其開放式的操控環境,研究人員得以在試管中任意拼裝不同的酵素,建構出精準的體外代謝途徑 (Cell-free metabolic engineering),來生產生質燃料、稀有醣類或特殊化學品。

 

Summary 小總結

       總結來說,CFPS 技術讓研究人員不需依賴細胞的複雜調控,改以更直接、更快速的方式,將目標基因轉譯成具有功能性的蛋白質。隨著技術不斷進步,無細胞合成系統正逐步在生物醫藥、綠色化學與精準醫療等領域中,扮演越來越重要的角色。 

 

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