與二代測序 Illumina平台最大的差別是，三代測序Nanopore透過物理方法，偵測 DNA鹼基通過膜蛋白孔的電荷變化，進而判斷其序列；這種技術可以直接從原始 DNA樣本中進行定序，並且能夠產生長讀長序列，對於大物種及連續重複序列的組裝提供更好的效果。

之前三代測序技術Nanopore的錯誤率 (5~10%) 明顯高於二代測序技術 Illumina (小於1%)，但是近期結合新開發的 R10.4.1 定序晶片與 Kit14，可提供高準確度且高產出的定序結果，進而提高準確度至 99%以上。

可以的，基因體組裝時，三代測序data在結構變異區的判斷及連續重複序列的辨識上通常會提供更好的效果。

我們使用 Agilent SureSelect Human Whole Exon建庫，測序建議至少需要 100倍的數據量，倘若需要增加測序深度，可以依據實驗需求提供客製化服務。

經甲醛固定處理後的檢體會破壞核苷酸結構使 DNA產生降解斷裂，因此會對測序品質產生影響，仍舊可以上機，同時也會建議客戶加大測序數據量以確保較高的定序深度及增加變異點的覆蓋率。